梅贻琦开师生会议，说到了日本的毒气战，从而说到清华应当开设工学院。
热河失陷，梅贻琦不准师生离校，认为热河失陷不是停课的借口和理由。
而顾毓琇提出要增开航空专业，为抵抗日本空军做准备。
荣千祥等三人炸火车被发现，钱伟长被人认出。
王副官派人来清华校园里找钱伟长，而他自己则直接到梅校长的办公室兴师问罪。
结果因为没有找到钱长伟，王副官只能离开。
水木清华第29集剧情介绍北平警察局怀疑清华的学生社团里有共产党员。
《雷雨》正在上演时，王副官带人闯进礼堂抓走了几名学生。
蒋南翔进城淘来了八一宣言，在校园里宣传。
钱伟长偶然发现学校里有日本人，并听到有人要来抓蒋南翔，立刻前去送信。
蒋南翔被抓走，荣千祥和几名学生将他救了出来。
水木清华第30集剧情介绍(大结局)学生们被困在体育馆，梅贻琦只好去找秦市长，总算圆满解决。
蒋南翔混进城里通报局势，正遇上城里的联络处暴露。
华罗庚去英国的事被否决了，教授会通过讨论决定华罗庚以访问学者的身份符剑桥大学进修。
蒋南翔决定去寻找共产党，梅贻琦表示支持并赠他路费。
梅贻琦开始着手建立长沙分校。
